RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SPATA33Q96N06 139 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TBX21Q9UL17 535 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CPLX1O14810 134 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FIBPO43427 364 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 B4GALT4O60513 344 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STAM2O75886 525 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CD4P01730 458 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF286BP0CG31 522 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TGFB3P10600 412 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RAG1P15918 1043 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AK2P54819 239 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPTC7Q8NI37 304 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LTBP2Q14767 1821 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KPNA6O60684 536 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ITGB5P18084 799 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ICAM3P32942 547 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DGKDQ16760 1214 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KAT2BQ92831 832 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IL17RAQ96F46 866 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ANO3Q9BYT9 981 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NEK4P51957 841 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SP4Q02446 784 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SCRN1Q12765 414 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NLRX1Q86UT6 975 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TDHQ8IZJ6 230 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 A0A1W2PPC1 479 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ESYT2A0FGR8 921 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATP9AO75110 1047 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LARGE1O95461 756 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TIMP1P01033 207 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CYP2C9P11712 490 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CYP2C18P33260 490 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EPHB4P54760 987 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GPRASP2Q96D09 838 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AIFM3Q96NN9 605 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ALG1Q9BT22 464 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HIPK3Q9H422 1215 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C6orf50Q9HD87 102 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PFKFB2O60825 505 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SREBF1P36956 1147 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PSEN2P49810 448 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FPGSQ05932 587 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AP3B2Q13367 1082 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MTMR1Q13613 665 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NEDD9Q14511 834 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ANKRD1Q15327 319 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 METTL7BQ6UX53 244 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NECAB1Q8N987 351 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPFIA4O75335 1185 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 F2P00734 622 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CSF2RAP15509 400 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KCNA2P16389 499 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ARHGAP4P98171 946 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MFSD10Q14728 455 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SHHQ15465 462 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ME3Q16798 604 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms