RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 C7orf72A4D263 438 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 H7C1D1 291 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MT-CO1P00395 513 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LSP1P33241 339 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 KSR2Q6VAB6 950 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TPH2Q8IWU9 490 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC12A8A0AV02 714 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 VSTM5A8MXK1 200 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 NPHS1O60500 1241 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LTFP02788 710 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PF4V1P10720 104 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM27P14373 513 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDE6AP16499 860 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 COL8A1P27658 744 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 BCL6P41182 706 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 OXCT1P55809 520 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC32Q14392 662 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 BRD3Q15059 726 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPR19Q15760 415 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LONRF3Q496Y0 759 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUSP27Q5VZP5 1158 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 OSTM1Q86WC4 334 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q8N1Y9 231 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 AIFM3Q96NN9 605 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLDND1Q9NY35 253 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ERC2O15083 957 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 AMY2AP04746 511 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 AMY2BP19961 511 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLCN7P51798 805 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 JAM2P57087 298 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LAPTM5Q13571 262 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GBX1Q14549 363 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF174Q15697 407 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF765Q7L2R6 523 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 DPF3Q92784 378 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNJ15Q99712 375 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SARGQ9BW04 601 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MKS1Q9NXB0 559 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUSP13Q9UII6 198 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM82A0PJX8 343 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM170BA6NMN3 283 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 WASH4PA8MWX3 477 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCDHGA12O60330 932 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPR3P46089 330 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 IRF9Q00978 393 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 ODF1Q14990 250 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 NLRP10Q86W26 655 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 NAT16Q8N8M0 369 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP33Q8TEY7 942 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 LMBR1Q8WVP7 490 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBE2FQ969M7 185 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM169Q96HH4 297 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.64□□□□□ -1.51
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