RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 SASH3O75995 380 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 CCDC122Q5T0U0 273 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 MKL1Q969V6 931 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 GUCA1BQ9UMX6 200 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 TEKT1Q969V4 418 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 NDST4Q9H3R1 872 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 WDR93Q6P2C0 686 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1328Q86T90 577 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 JAKMIP2Q96AA8 810 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 TSG101Q99816 390 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 SIK3Q9Y2K2 1263 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 MCM3P25205 808 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 USP11P51784 963 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 GMLQ99445 158 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 LCA5LO95447 670 aa26.4■■□□□ 1.82
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PMS1-205ENST00000409985 HDXQ7Z353 690 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 DCAF4Q8WV16 495 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 SAR1BQ9Y6B6 198 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 CYP3A7P24462 503 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 TNNI2P48788 182 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 VAV2P52735 878 aa26.4■■□□□ 1.82
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PMS1-205ENST00000409985 DDX12PQ92771 950 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 HAS1Q92839 578 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 MBOAT7Q96N66 472 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 NYAP2Q9P242 653 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 GPS2Q13227 327 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-205ENST00000409985 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
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PMS1-205ENST00000409985 SHTN1A0MZ66 631 aa26.38■■□□□ 1.81
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PMS1-205ENST00000409985 TAF3Q5VWG9 929 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 LRRC55Q6ZSA7 311 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 TXLNBQ8N3L3 684 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.38■■□□□ 1.81
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PMS1-205ENST00000409985 L1RE1Q9UN81 338 aa26.38■■□□□ 1.81
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PMS1-205ENST00000409985 PKNOX2Q96KN3 472 aa26.38■■□□□ 1.81
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PMS1-205ENST00000409985 CEP63Q96MT8 703 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
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PMS1-205ENST00000409985 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.37■■□□□ 1.81
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PMS1-205ENST00000409985 KLK7P49862 253 aa26.35■■□□□ 1.81
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PMS1-205ENST00000409985 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.35■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.35■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 TRIM58Q8NG06 486 aa26.35■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 HPS3Q969F9 1004 aa26.35■■□□□ 1.81
PMS1-205ENST00000409985 IDI2Q9BXS1 227 aa26.35■■□□□ 1.81
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