RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SGK1O00141 431 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 DAPK3O43293 454 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 PLS3P13797 630 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 PLCG2P16885 1265 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 NR2F2P24468 414 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 DEUP1Q05D60 604 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 NEK8Q86SG6 692 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 PACS2Q86VP3 889 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 RASGRP4Q8TDF6 673 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SMYD3Q9H7B4 428 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 KDM5CP41229 1560 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 PDE6AP16499 860 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SLC12A2P55011 1212 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 RGS9BPQ6ZS82 235 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TPH2Q8IWU9 490 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SEC16BQ96JE7 1060 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SCYL1Q96KG9 808 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 CCDC138Q96M89 665 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 MAST3O60307 1309 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TRIM49BA6NDI0 452 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 LGALS16A8MUM7 142 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 RASA4BC9J798 803 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 M0R2C6 588 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 RASA4O43374 803 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TOM1L1O75674 476 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 HAUS5O94927 633 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TTC4O95801 387 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ERFP50548 548 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 PMS2P54278 862 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 CYFIP2Q96F07 1278 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 FAM161BQ96MY7 647 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 LZTS2Q9BRK4 669 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 MAGEF1Q9HAY2 307 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 NDE1Q9NXR1 346 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 KCNQ3O43525 872 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 LRRN2O75325 713 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 PRR29P0C7W0 189 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SAT1P21673 171 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 JADE1Q6IE81 842 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 CYB5D1Q6P9G0 228 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 LPIN2Q92539 896 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SDCCAG3Q96C92 435 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ZNF653Q96CK0 615 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 L2HGDHQ9H9P8 463 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TTC26A0AVF1 554 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SH3BP5O60239 455 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 KRT14P02533 472 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 KCNA3P22001 575 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 TTBK2Q6IQ55 1244 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 NLRP3Q96P20 1036 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 NOD2Q9HC29 1040 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ABCC12Q96J65 1359 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SLC8A3P57103 927 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 PDE1BQ01064 536 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 RHBDL2Q9NX52 303 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 KDRP35968 1356 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ADGRL2O95490 1459 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 H3BQF6 201 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 AFPP02771 609 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 KRT10P13645 584 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 BRAFP15056 766 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 CNGA1P29973 690 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 LMNB2Q03252 620 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 KIF2BQ8N4N8 673 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 DTX3LQ8TDB6 740 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 CUEDC2Q9H467 287 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 LZTS1Q9Y250 596 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP10A1A4S6 786 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 USP17L12C9JPN9 530 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 USP17L21D6R901 530 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 GPC4O75487 556 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 CCND1P24385 295 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-202ENST00000402738 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms