RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM199Q8N511 208 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 KAT2BQ92831 832 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP2C18P33260 490 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 EVCP57679 992 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE2SQ16763 222 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 FIBPO43427 364 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 PPFIA4O75335 1185 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 CSF2RAP15509 400 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 NAPAP54920 295 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA33Q96N06 139 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 BARHL2Q9NY43 387 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2E3-201ENST00000392415 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SEMA3FQ13275 785 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SESTD1Q86VW0 696 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 STXBP3O00186 592 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SORBS3O60504 671 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 F2P00734 622 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP2C9P11712 490 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 NEDD9Q14511 834 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 HAS3O00219 553 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 NTRK3Q16288 839 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL7BQ6UX53 244 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRX1Q86UT6 975 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 IL23AQ9NPF7 189 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SMCO2A6NFE2 343 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF286BP0CG31 522 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PSEN2P49810 448 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 CCL23P55773 120 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 CHMP4BP1P59074 171 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM240Q5SV17 173 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 GPRASP2Q96D09 838 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SCG2P13521 617 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 ADCY7P51828 1080 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 COL6A3P12111 3177 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 ACRP10323 421 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGB5P18084 799 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 MFSD10Q14728 455 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PKN1Q16512 942 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PTGISQ16647 500 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 CDHR1Q96JP9 859 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3-201ENST00000392415 PITPNM1O00562 1244 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 MAFGO15525 162 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 IFNAR1P17181 557 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 RASIP1Q5U651 963 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF365Q70YC5 407 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 DEFB123Q8N688 67 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 C7orf31Q8N865 590 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 PHKBQ93100 1093 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 ALG1Q9BT22 464 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 NOD1Q9Y239 953 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 CDH23Q9H251 3354 aa23.57■■□□□ 1.36
UBE2E3-201ENST00000392415 ESYT2A0FGR8 921 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms