RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 ZEB2O60315 1214 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-202ENST00000381222 MARK3P27448 753 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-202ENST00000381222 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-202ENST00000381222 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.33■□□□□ 0.21
ZBED1-202ENST00000381222 KSR1Q8IVT5 923 aa16.33■□□□□ 0.21
ZBED1-202ENST00000381222 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
ZBED1-202ENST00000381222 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
ZBED1-202ENST00000381222 ASNSP08243 561 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 DCAF15Q66K64 600 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 KRT26Q7Z3Y9 468 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MAP3K14Q99558 947 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 TTC26A0AVF1 554 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CETN2P41208 172 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SELENOOQ9BVL4 669 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.33■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CD19P15391 556 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 OSTNP61366 133 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 STRN3Q13033 797 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 C8orf74Q6P047 294 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 USP37Q86T82 979 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 DYDC2Q96IM9 177 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CHP1Q99653 195 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 KCNK3O14649 394 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SLC37A4O43826 429 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 FTCDO95954 541 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MTERF2Q49AM1 385 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CEP170P1Q96L14 293 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 AZI2Q9H6S1 392 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 POTEB2H3BUK9 544 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 STAT1P42224 750 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 GUCY2FP51841 1108 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MB21D1Q8N884 522 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 ZMYND15Q9H091 742 aa16.32■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 RMDN3Q96TC7 470 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MFAP3LO75121 409 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MOCS3O95396 460 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SLC15A2Q16348 729 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MTA3Q9BTC8 594 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 TRIM9Q9C026 710 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 WNT7AO00755 349 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 GFPT2O94808 682 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 HMGCS2P54868 508 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 TRPC6Q9Y210 931 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 VPS41P49754 854 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 KLK7P49862 253 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 PEX26Q7Z412 305 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 STK17AQ9UEE5 414 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 LTN1O94822 1766 aa16.31■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 NDUFA10O95299 355 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CAPN2P17655 700 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 PEX3P56589 373 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CYTH3O43739 400 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 RCAN1P53805 252 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MAN2A1Q16706 1144 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 WDR44Q5JSH3 913 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 GBP6Q6ZN66 633 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 DAAM2Q86T65 1068 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 HSF2BPO75031 334 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 DEPTORQ8TB45 409 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 WDR24Q96S15 920 aa16.3■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 A0A087X0B3 334 aa16.29■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MYMKA6NI61 221 aa16.29■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MCM3P25205 808 aa16.29■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 VAV2P52735 878 aa16.29■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 COASYQ13057 564 aa16.29■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
ZBED1-202ENST00000381222 HDAC6Q9UBN7 1215 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms