RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 UFL1O94874 794 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NGLY1Q96IV0 654 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 H0Y3Z8 333 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 LIG4P49917 911 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PNMA1Q8ND90 353 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KLC4Q9NSK0 619 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TOM1L1O75674 476 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MYO1EQ12965 1108 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 DRP2Q13474 957 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 FGD4Q96M96 766 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 A6NJR5 290 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC188H7C350 402 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 AP2B1P63010 937 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RUBCNQ92622 972 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 COBLO75128 1261 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SLFN14P0C7P3 912 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 STAP2Q9UGK3 403 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PODXLO00592 558 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KRT10P13645 584 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SRLQ86TD4 932 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 DCLK2Q8N568 766 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 FTCDO95954 541 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF653Q96CK0 615 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 FAM81BQ96LP2 452 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MT-ND3P03897 115 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PTPN21Q16825 1174 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SEMA3EO15041 775 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TAF5LO75529 589 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SPC25Q9HBM1 224 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KCNA4P22459 653 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 BIRC2Q13490 618 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RFX6Q8HWS3 928 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RASSF10A6NK89 507 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 LRRN2O75325 713 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 A0A087WWV3 80 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CEP19Q96LK0 163 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CAPN9O14815 690 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RANBP1P43487 201 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RWDD2BP57060 319 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PPP2R2AP63151 447 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NLRX1Q86UT6 975 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NLRP14Q86W24 1093 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 FGGP02679 453 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PRPSAP1Q14558 356 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RIMBP2O15034 1052 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PALMDQ9NP74 551 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KRT82Q9NSB4 513 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 WDR91A4D1P6 747 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRT-204ENST00000373190 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KLRF2D3W0D1 207 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CENPUQ71F23 418 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NDE1Q9NXR1 346 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SUFUQ9UMX1 484 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GINS2Q9Y248 185 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0G2JND7 137 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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