RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 RGS20O76081 388 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 SUGCTQ9HAC7 445 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 KLRF2D3W0D1 207 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF286BP0CG31 522 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 TGFB3P10600 412 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 NUCB1Q02818 461 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 MBTPS1Q14703 1052 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 WNT8BQ93098 351 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC01553A4QN01 128 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZBTB5O15062 677 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 LGR5O75473 907 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLA2G5P39877 138 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 HIC1Q14526 733 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 SEC23AQ15436 765 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPATA33Q96N06 139 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 INSL6Q9Y581 213 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 EMSYQ7Z589 1322 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGHDP01880 384 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SP2Q02086 613 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRAF1Q13077 416 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PGM5Q15124 567 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SERINC5Q86VE9 423 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM122AQ96E09 287 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 GGPS1O95749 300 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 RSPH10BP0C881 870 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 AMHP03971 560 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 POLR2MP0CAP2 368 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCND2P30279 289 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 HOXC8P31273 242 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 THPOP40225 353 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL31RAQ8NI17 732 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 H3BRB1 525 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SORBS3O60504 671 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPR37L1O60883 481 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PIEZO1Q92508 2521 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 CAND2O75155 1236 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LGALS2P05162 132 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 ICAM3P32942 547 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRDNQ13061 729 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 GRM4Q14833 912 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 9.4
TRAPPC3-201ENST00000373159 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TOP1MTQ969P6 601 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms