RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 CYP2C19P33261 490 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 KCNQ2O43526 872 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 MMP10P09238 476 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RANBP1P43487 201 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 LIG4P49917 911 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 UBE2SQ16763 222 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC151A5D8V7 595 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CROCCP2Q86T23 111 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RAB17Q9H0T7 212 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF609O15014 1411 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CIB2O75838 187 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 OXER1Q8TDS5 423 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 H0YCG3 227 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 NMT2O60551 498 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CHGBP05060 677 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 KRIT1O00522 736 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 STAT2P52630 851 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RASSF7Q02833 373 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 MTMR3Q13615 1198 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PTPROQ16827 1216 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RAD17O75943 681 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CLTAP09496 248 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GAP43P17677 238 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 SLC20A2Q08357 652 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 VSIG1Q86XK7 387 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 THAP9Q9H5L6 903 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 ENC1O14682 589 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 GAS8O95995 478 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 TECPR2O15040 1411 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 SNX16P57768 344 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 ZBED6P86452 979 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 ARID5BQ14865 1188 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 PDIA6Q15084 440 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 PPP2R5EQ16537 467 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 KRT71Q3SY84 523 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 DONSONQ9NYP3 566 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 MEIS1O00470 390 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 ADRA2BP18089 450 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 REREQ9P2R6 1566 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 CSF1RP07333 972 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 RASSF2P50749 326 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 GUCY2FP51841 1108 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 EHHADHQ08426 723 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 DIP2AQ14689 1571 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 SEPT2Q15019 361 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 KRT31Q15323 416 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 MASTLQ96GX5 879 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 NACC1Q96RE7 527 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 CPVLQ9H3G5 476 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-204ENST00000368210 GDAQ9Y2T3 454 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms