RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 TBX1O43435 398 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 TADA3O75528 432 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 CYP7B1O75881 506 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ITGAVP06756 1048 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 SRRDQ9UH36 339 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 IL13P35225 146 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 LTBRP36941 435 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CLIC6Q96NY7 704 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 WRNIP1Q96S55 665 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ECI1P42126 302 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 GFRA1P56159 465 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 LSAMPQ13449 338 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CDSNQ15517 529 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 STEAP3Q658P3 488 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 TEPPQ6URK8 271 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM209Q96SK2 561 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SUSD5O60279 629 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 EPHB4P54760 987 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ICAM4Q14773 271 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SV2CQ496J9 727 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 TNNI3KQ59H18 835 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 DNERQ8NFT8 737 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf159Q96HA4 380 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CD248Q9HCU0 757 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 GPR42O15529 346 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 DGKIO75912 1065 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 LRG1P02750 347 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CAPNS1P04632 268 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PPP2CBP62714 309 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PPP2CAP67775 309 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 MAFKO60675 156 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 FSHBP01225 129 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 C6P13671 934 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 LCP1P13796 627 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 TACR2P21452 398 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SPRED1Q7Z699 444 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 KLC2Q9H0B6 622 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CLDND1Q9NY35 253 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 MYOTQ9UBF9 498 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 WASF3Q9UPY6 502 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CDIP1Q9H305 208 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 CROTQ9UKG9 612 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-202ENST00000368205 B2RBV5 119 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms