RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PLCG1P19174 1290 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 NME8Q8N427 588 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 THAP9Q9H5L6 903 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV5-2P06315 115 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L3A6NCW0 530 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L4A6NCW7 530 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 NPR1P16066 1061 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC38Q502W7 563 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CDKL2Q92772 493 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ABL1P00519 1130 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 FAM182BQ5T319 152 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G4BP0C869 781 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CLIC2O15247 247 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RAD17O75943 681 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP4P98171 946 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK4P31152 587 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MEIS1O00470 390 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PFDN6O15212 129 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC63Q05C16 580 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 VSTM4Q8IW00 320 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ATP8B1O43520 1251 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 OATP04181 439 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WWV3 80 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 LRRN2O75325 713 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KA4O75676 772 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MXI1P50539 228 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PAGE5Q96GU1 130 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA6P17066 643 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 AKT3Q9Y243 479 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RSPH3Q86UC2 560 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPP22059 807 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 GCNT4Q9P109 453 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.02■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.02■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 CCND2P30279 289 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ALCAMQ13740 583 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 NDST4Q9H3R1 872 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 EPHB4P54760 987 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ITKQ08881 620 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 HLFQ16534 295 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 APOL6Q9BWW8 343 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2SQ16763 222 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 FAM133AQ8N9E0 248 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PDE11AQ9HCR9 933 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 MTA3Q9BTC8 594 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PTPREP23469 700 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 GARSP41250 739 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ASNSP08243 561 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PANX2Q96RD6 677 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 RXRBP28702 533 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 CUL4BQ13620 913 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms