RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366170.6

VSTM1-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1-202ENST00000366170 FERMT2Q96AC1 680 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 GPRASP2Q96D09 838 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 CDHR1Q96JP9 859 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MTMR9Q96QG7 549 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TINF2Q9BSI4 451 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ELP1O95163 1332 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 LCTP09848 1927 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MSH4O15457 936 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 FLT3LGP49771 235 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 GABRQQ9UN88 632 aa14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MCM3APO60318 1980 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TECP42680 631 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ADALQ6DHV7 355 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 HAS1Q92839 578 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 LENG9Q96B70 501 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 APBA2Q99767 749 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 RAB34Q9BZG1 259 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.66□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 GAS7O60861 476 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 RGS20O76081 388 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TGFB3P10600 412 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PTMSP20962 102 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ICAM3P32942 547 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PRKCZQ05513 592 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PDIA5Q14554 519 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 IL17AQ16552 155 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 CCL14Q16627 93 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SLC5A5Q92911 643 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 GJA10Q969M2 543 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 CLIC6Q96NY7 704 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 RIT2Q99578 217 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SDF4Q9BRK5 362 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 CSRNP2Q9H175 543 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 VTA1Q9NP79 307 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SRRDQ9UH36 339 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.65□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ATP9AO75110 1047 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 PRMT2P55345 433 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 UBE2HP62256 183 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 IRF5Q13568 498 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 ACVR2BQ13705 512 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 NFKBIBQ15653 356 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 RAET1EQ8TD07 263 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.64□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 A0A1W2PQ27 194 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 A0A1W2PQ64 194 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 A0A1W2PQD8 194 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 CMA1P23946 247 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 CYP2C19P33261 490 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 UBA7P41226 1012 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 CAP1Q01518 475 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 GRIN1Q05586 938 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 SEMA3FQ13275 785 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 NEDD9Q14511 834 aa14.63□□□□□ -0.07
VSTM1-202ENST00000366170 TTLL4Q14679 1199 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms