RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-202ENST00000361368 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 TTI1O43156 1089 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 CIITAP33076 1130 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 MAN2A1Q16706 1144 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 EHHADHQ08426 723 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SLC39A14Q15043 492 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PGBD1Q96JS3 809 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 HSPA6P17066 643 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 CDR2Q01850 454 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 DONSONQ9NYP3 566 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 TLK1Q9UKI8 766 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 RASSF7Q02833 373 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ERVV-1B6SEH8 477 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 BAG2O95816 211 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 KRT1P04264 644 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 NPR1P16066 1061 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 INPP1P49441 399 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 EPHB1P54762 984 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 CLGNO14967 610 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 NDUFA8P51970 172 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PPARDQ03181 441 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PSMD2Q13200 908 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 MID2Q9UJV3 735 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PEG3Q9GZU2 1588 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 M0R2C6 588 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 TBCKQ8TEA7 893 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ADAMTS12P58397 1594 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 CLIC4Q9Y696 253 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 RGS12O14924 1447 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 USP17L3A6NCW0 530 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 USP17L4A6NCW7 530 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 APOA5Q6Q788 366 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 C7orf31Q8N865 590 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 IGSF3O75054 1194 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 CASP2P42575 452 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PTPROQ16827 1216 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ERFEQ4G0M1 354 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 MED4Q9NPJ6 270 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ADORA1P30542 326 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PIGSQ96S52 555 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SCRN1Q12765 414 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 TCP11Q8WWU5 503 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 MAP4K1Q92918 833 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 TTC25Q96NG3 672 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PRPSAP2O60256 369 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 MTERF2Q49AM1 385 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 CAPS2Q9BXY5 557 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 GNAT1P11488 350 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 DCLK2Q8N568 766 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 PARVGQ9HBI0 331 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SMIM24O75264 130 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SGO2Q562F6 1265 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 TMEM94Q12767 1356 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ECEL1O95672 775 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 MSH2P43246 934 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ADD2P35612 726 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 KCTD6Q8NC69 237 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 SERPINB6P35237 376 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-202ENST00000361368 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms