RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 CCNA1P78396 465 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PPP2R5AQ15172 486 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 MTERF2Q49AM1 385 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 VSTM4Q8IW00 320 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 MED4Q9NPJ6 270 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PRDX5P30044 214 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 LIFRP42702 1097 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ARID5BQ14865 1188 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PLA2G4BP0C869 781 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 P3H4Q92791 437 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 MED14O60244 1454 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 COL15A1P39059 1388 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 STX2P32856 288 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 BFSP1Q12934 665 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 LMNB1P20700 586 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 STK17AQ9UEE5 414 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.96■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 USP17L5A8MUK1 530 aa22.95■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ATF2P15336 505 aa22.95■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.95■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 NMT2O60551 498 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 MAN2A1Q16706 1144 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PHBP35232 272 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RILPQ96NA2 401 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 CRKP46108 304 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ATP1A2P50993 1020 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 TTLL6Q8N841 843 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RETREG2Q8NC44 543 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 OSTNP61366 133 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SARM1Q6SZW1 724 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GH2P01242 217 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 CLCN6P51797 869 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 NAA25Q14CX7 972 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RFX6Q8HWS3 928 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GFPT2O94808 682 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 DDIT3P35638 169 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GUCY2DQ02846 1103 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 CPVLQ9H3G5 476 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GCNT4Q9P109 453 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RNF8O76064 485 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 OATP04181 439 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 NLRP7Q8WX94 980 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ATP2A3Q93084 1043 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PSMD6Q15008 389 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF653Q96CK0 615 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 NARFQ9UHQ1 456 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 H7C0C1 242 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ATP5OP48047 213 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 HAUS1Q96CS2 278 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ATP1A3P13637 1013 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 A6NJR5 290 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 FAM196BA6NMK8 535 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 MARK3P27448 753 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM206Q9H813 350 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SFI1A8K8P3 1242 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms