RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
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PTPRU-201ENST00000345512 SH2D4AQ9H788 454 aa16.98■□□□□ 0.31
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PTPRU-201ENST00000345512 SEMA3FQ13275 785 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-201ENST00000345512 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
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PTPRU-201ENST00000345512 CEP95Q96GE4 821 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-201ENST00000345512 E9PMD0 336 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-201ENST00000345512 IRAK1P51617 712 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-201ENST00000345512 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-201ENST00000345512 DNAJC7Q99615 494 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-201ENST00000345512 GCNT4Q9P109 453 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-201ENST00000345512 STK24Q9Y6E0 443 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC169A6NNP5 214 aa16.97■□□□□ 0.31
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