RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PLS1Q14651 629 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 LBX2Q6XYB7 198 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 HAS1Q92839 578 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SDF4Q9BRK5 362 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PANK2Q9BZ23 570 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FAM86B1E9PN63 330 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ZNF76P36508 570 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GTF2A2P52657 109 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 UBXN2AP68543 259 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CNNM3Q8NE01 707 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FAM212AQ96EL1 285 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 AK8Q96MA6 479 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 BTBD7Q9P203 1132 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 LCTP09848 1927 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PP2D1A8MPX8 630 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CNMDO75829 334 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CETPP11597 493 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TXLNAP40222 546 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 HERVK_113P62684 666 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R5AQ15172 486 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PRR16Q569H4 304 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PDILTQ8N807 584 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 LENG9Q96B70 501 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 DHX58Q96C10 678 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ACAD9Q9H845 621 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CCDC192P0DO97 292 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 NSMFQ6X4W1 530 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MAF1Q9H063 256 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 USP25Q9UHP3 1055 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TBX3O15119 743 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PEX10O60683 326 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CDC25AP30304 524 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PDIA5Q14554 519 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 E2F4Q16254 413 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SPRYD7Q5W111 196 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 KANK3Q6NY19 840 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CABP7Q86V35 215 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CHST13Q8NET6 341 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GJA10Q969M2 543 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RAB34Q9BZG1 259 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TYRO3Q06418 890 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PNOCQ13519 176 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RBSNQ9H1K0 784 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PASKQ96RG2 1323 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FOXN1O15353 648 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MSH4O15457 936 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SLFN14P0C7P3 912 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 UBA7P41226 1012 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PGM5Q15124 567 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CCL15Q16663 113 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.78□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.78□□□□□ -1.32
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