RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340587.7

LHX6-201, Transcript of LIM homeobox 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX6, Length 3,457 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6-201ENST00000340587 MYBL2P10244 700 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 CUL5Q93034 780 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 POLLQ9UGP5 575 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SNX12Q9UMY4 172 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 A0A1W2PQJ5 194 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 E9PMD0 336 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 LRRC63Q05C16 580 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SH2D4AQ9H788 454 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 COASYQ13057 564 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 MXD3Q9BW11 206 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP40Q9NVE5 1235 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 ESYT2A0FGR8 921 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L10C9JJH3 530 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 FIGNQ5HY92 759 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L15C9J2P7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L11C9JVI0 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L18D6R9N7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L22D6RA61 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L19D6RCP7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L20D6RJB6 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 RGL2O15211 777 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 TTLL1O95922 423 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L24Q0WX57 530 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 LAMB1P07942 1786 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 RUFY1Q96T51 708 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SLC1A4P43007 532 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 APBA1Q02410 837 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 DOK7Q18PE1 504 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 GPBP1Q86WP2 473 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 FAM196BA6NMK8 535 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 ECM1Q16610 540 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 IQCDQ96DY2 449 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 NOX5Q96PH1 765 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 POTEB3A0JP26 581 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 POTECB2RU33 542 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 ZNF543Q08ER8 600 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 POTEBQ6S5H4 581 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 USP21Q9UK80 565 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX6-201ENST00000340587 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 IL1R1P14778 569 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 SMARCA1P28370 1054 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 TCP10Q12799 353 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 PDIA5Q14554 519 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 VPS72Q15906 364 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
LHX6-201ENST00000340587 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms