RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 DONSONQ9NYP3 566 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 SMAPO00193 183 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 MYOM2P54296 1465 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 H7C0S8 307 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 PANK4Q9NVE7 773 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 MCM9Q9NXL9 1143 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 TLK1Q9UKI8 766 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 TNNC2P02585 160 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CASP10Q92851 521 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 ECT2Q9H8V3 914 aa5.94□□□□□ -1.46
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