RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 KCNQ4P56696 695 aa27.91■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 PIGSQ96S52 555 aa27.91■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 GOLPH3Q9H4A6 298 aa27.91■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 TDP2O95551 362 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R2P41236 205 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 NAA35Q5VZE5 725 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 KDM7AQ6ZMT4 941 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 UIMC1Q96RL1 719 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 FNTAP49354 379 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 ECM1Q16610 540 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 KLHL7Q8IXQ5 586 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D5Q92609 795 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 IQCDQ96DY2 449 aa27.9■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 RAD51CO43502 376 aa27.89■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.89■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 DDX12PQ92771 950 aa27.89■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D7Q9P0N9 293 aa27.89■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 LAMB2P55268 1798 aa27.89■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SENP3-201ENST00000321337 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 NR1D1P20393 614 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 RASA1P20936 1047 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 PAK2Q13177 524 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 MTMR9Q96QG7 549 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 A0A087X0T9 212 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 FAM228BP0C875 321 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 OR2W6PQ8NHA6 318 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 C6orf50Q9HD87 102 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 MNAT1P51948 309 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 YY1AP1Q9H869 796 aa27.88■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 NAB2Q15742 525 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CALCRLQ16602 461 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 SFMBT2Q5VUG0 894 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CNPY4Q8N129 248 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 OTUD6BQ8N6M0 293 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 EPN3Q9H201 632 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 PTGISQ16647 500 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 PLAAQ9Y263 795 aa27.87■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 HPDP32754 393 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 MEI1Q5TIA1 1274 aa27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 RAD54LQ92698 747 aa27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 LRRC63Q05C16 580 aa27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CEP85LQ5SZL2 805 aa27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CENPHQ9H3R5 247 aa27.86■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 GRID2IPA4D2P6 1211 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 TRAF5O00463 557 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R37O75864 691 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 MAATS1Q7Z4T9 603 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 COA7Q96BR5 231 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 SERPING1P05155 500 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 RAPGEF1Q13905 1077 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CCDC40Q4G0X9 1142 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 NELFCDQ8IXH7 590 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 FAM133AQ8N9E0 248 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 SNX29Q8TEQ0 813 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa27.85■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 ERVK-9P63128 1117 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 SOGA3Q5TF21 947 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CCT8L2Q96SF2 557 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 CEP72Q9P209 647 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 GNA11P29992 359 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 MREGQ8N565 214 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa27.84■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 ABCB11O95342 1321 aa27.83■■■□□ 2.05
SENP3-201ENST00000321337 ZCWPW2Q504Y3 356 aa27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms