RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298260.8

SKA3-201, Transcript of spindle and kinetochore associated complex subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene SKA3, Length 2,803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA3-201ENST00000298260 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 GGA2Q9UJY4 613 aa14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.83□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ITGA4P13612 1032 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 MEGF6O75095 1541 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 TLDC2A0PJX2 215 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 KIF4AO95239 1232 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 WHAMMQ8TF30 809 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.82□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SPEF2Q9C093 1822 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SHBGP04278 402 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ASIC1P78348 528 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SPAG5Q96R06 1193 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 NDST4Q9H3R1 872 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 AMACRQ9UHK6 382 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CEP104O60308 925 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 RASGRF1Q13972 1273 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SEC23AQ15436 765 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.81□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 MAP3K13O43283 966 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 TLR2O60603 784 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CAND2O75155 1236 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 COPB2P35606 906 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 UBA7P41226 1012 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 MAP3K12Q12852 859 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ERICH1Q86X53 443 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 USP38Q8NB14 1042 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 RETREG2Q8NC44 543 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 RUBCNQ92622 972 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 EBF2Q9HAK2 575 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 RHOBTB3O94955 611 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CCNE1P24864 410 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 HGSNATQ68CP4 663 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 BAP1Q92560 729 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 TBC1D5Q92609 795 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.8□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 C5orf60A6NFR6 353 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ORC4O43929 436 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 LRRC41Q15345 812 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 HOOK2Q96ED9 719 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 MYH1P12882 1939 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CHN1P15882 459 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 PLCG1P19174 1290 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SLC8A3P57103 927 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SPATA5Q8NB90 893 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 SAAL1Q96ER3 474 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ABCC12Q96J65 1359 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 A0A087X0T9 212 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 FAM228BP0C875 321 aa14.79□□□□□ -0.04
SKA3-201ENST00000298260 ABL2P42684 1182 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms