RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 CHRDL2Q6WN34 429 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 ANO3Q9BYT9 981 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 FIBPO43427 364 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 GGPS1O95749 300 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 MMP3P08254 477 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 GNA11P29992 359 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 ME3Q16798 604 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 NLRX1Q86UT6 975 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 TOX2Q96NM4 488 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.58■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 DOCK5Q9H7D0 1870 aa28.57■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 LARGE1O95461 756 aa28.57■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 SEMA3FQ13275 785 aa28.57■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 ITGA7Q13683 1181 aa28.57■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.57■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.57■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.57■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 DCDC2CA8MYV0 355 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 GRIN2DO15399 1336 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 CLTBP09497 229 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 ITGB5P18084 799 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 MCTP2Q6DN12 878 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 NECAB1Q8N987 351 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 SLC43A3Q8NBI5 491 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 ADAMTS3O15072 1205 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 PPTC7Q8NI37 304 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 BICD2Q8TD16 824 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 GTF3C6Q969F1 213 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 GPRASP2Q96D09 838 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA33Q96N06 139 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.55■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 DTNBO60941 627 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 SREBF1P36956 1147 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 NLRP5P59047 1200 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 NEDD9Q14511 834 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 DGKDQ16760 1214 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 CDHR1Q96JP9 859 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 AIFM3Q96NN9 605 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 LTBP2Q14767 1821 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 CTDNEP1O95476 244 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 FAAP100Q0VG06 881 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 JADE2Q9NQC1 790 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 STK36Q9NRP7 1315 aa28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 CHMP4BP1P59074 171 aa28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 MTMR1Q13613 665 aa28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.52■■■□□ 2.16
CXCL2-201ENST00000296031 MAFGO15525 162 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 PPFIA4O75335 1185 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGAP4P98171 946 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 METTL7BQ6UX53 244 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 GDF15Q99988 308 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 CEP55Q53EZ4 464 aa28.5■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.5■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 PRO3102Q9H379 93 aa28.5■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.5■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.5■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0355O15063 1070 aa28.49■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 ATP9AO75110 1047 aa28.49■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF286BP0CG31 522 aa28.49■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF76P36508 570 aa28.49■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.49■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.49■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 CD4P01730 458 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 KCNA2P16389 499 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 SP4Q02446 784 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 RABEP1Q15276 862 aa28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms