RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 KLRF2D3W0D1 207 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 HAS3O00219 553 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 F2P00734 622 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 HSD17B4P51659 736 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 RBL2Q08999 1139 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 IKBKEQ14164 716 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 SPATA33Q96N06 139 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 RAD9AQ99638 391 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.55■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 HIP1O00291 1037 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 RGS20O76081 388 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 GJB5O95377 273 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 GGPS1O95749 300 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 NUCB1Q02818 461 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 HIC1Q14526 733 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 MBTPS1Q14703 1052 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 HOMER1Q86YM7 354 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.54■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.53■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.53■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 IL31RAQ8NI17 732 aa20.53■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.53■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 LINC01553A4QN01 128 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 ZBTB5O15062 677 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 PPFIA4O75335 1185 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 THPOP40225 353 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 SP2Q02086 613 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 PGM5Q15124 567 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 IL25Q9H293 177 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.52■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 LGR5O75473 907 aa20.51■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 ERVK-21P61565 698 aa20.51■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 SEC23AQ15436 765 aa20.51■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.51■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.51■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.51■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 MTMR8Q96EF0 704 aa20.51■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.51■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 EFCAB14O75071 495 aa20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 RSPH10BP0C881 870 aa20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 FAM122AQ96E09 287 aa20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 PIGSQ96S52 555 aa20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.5■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 POLR2MP0CAP2 368 aa20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 CCND2P30279 289 aa20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 GHRHRQ02643 423 aa20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 SIP14410 1827 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 AMHP03971 560 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 PLA2G5P39877 138 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 SERINC5Q86VE9 423 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 INSL6Q9Y581 213 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.48■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 H3BRB1 525 aa20.47■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 AAMPQ13685 434 aa20.47■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 SENP2Q9HC62 589 aa20.47■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 EMSYQ7Z589 1322 aa20.47■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 TREHO43280 583 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 LGALS2P05162 132 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 CTSHP09668 335 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.46■□□□□ 0.87
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