RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261489.6

TSC22D1-201, Transcript of TSC22 domain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSC22D1, Length 3,135 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-201ENST00000261489 ATAD5Q96QE3 1844 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 PIK3CDO00329 1044 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 GAS7O60861 476 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 IDEP14735 1019 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 LONP1P36776 959 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 HSD17B4P51659 736 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 STX17P56962 302 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 PGM5Q15124 567 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 KRT79Q5XKE5 535 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 PXMP2Q9NR77 195 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 USP25Q9UHP3 1055 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CETPP11597 493 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 OSBPP22059 807 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 GTF2A2P52657 109 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 MTMR1Q13613 665 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ASTN1O14525 1302 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 POTEB2H3BUK9 544 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 SLFN14P0C7P3 912 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 BMP6P22004 513 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ERVK-9P63128 1117 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ERVK-24P63145 666 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 25.4
TSC22D1-201ENST00000261489 BANK1Q8NDB2 785 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 RGS22Q8NE09 1264 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.99□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 MED24O75448 989 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CNMDO75829 334 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 YY1P25490 414 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CHMP4BP1P59074 171 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 TRAF1Q13077 416 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 FSD2A1L4K1 749 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 SFI1A8K8P3 1242 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 AOC2O75106 756 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 GRB10Q13322 594 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 TKFCQ3LXA3 575 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 RGMBQ6NW40 437 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CALML4Q96GE6 196 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CBX8Q9HC52 389 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 BECN2A8MW95 431 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 RGS20O76081 388 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 KCTD2Q14681 263 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 E2F4Q16254 413 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 SMARCE1Q969G3 411 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.98□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 PNMA5Q96PV4 448 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 RAB34Q9BZG1 259 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 DOCK1Q14185 1865 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 LAD1O00515 517 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 DYDC2Q96IM9 177 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 GDAQ9Y2T3 454 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 SCN4AP35499 1836 aa9.97□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 PRPHP41219 470 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ASIC1P78348 528 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 SP2Q02086 613 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.96□□□□□ -0.81
TSC22D1-201ENST00000261489 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.96□□□□□ -0.82
TSC22D1-201ENST00000261489 MRE11P49959 708 aa9.96□□□□□ -0.82
TSC22D1-201ENST00000261489 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.96□□□□□ -0.82
TSC22D1-201ENST00000261489 LY6KQ17RY6 165 aa9.96□□□□□ -0.82
TSC22D1-201ENST00000261489 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.96□□□□□ -0.82
TSC22D1-201ENST00000261489 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms