RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000043498.7

Hdac3-201, Transcript of Histone deacetylase 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hdac3, Length 2,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Krt82Q99M74 516 aa25.97■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Med4Q9CQA5 270 aa25.97■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sbno2Q7TNB8 1349 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 SrcapA0A087WQ44 3271 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nkx1-1G3UXB3 402 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fscn2Q32M02 492 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rec8Q8C5S7 591 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ces4aQ8R0W5 563 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Med24Q99K74 987 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Hic1Q9R1Y5 733 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tulp1Q9Z273 543 aa25.96■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dhtkd1A2ATU0 921 aa25.95■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cfap58B2RW38 873 aa25.95■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Barx2O08686 283 aa25.95■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa25.95■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dph1Q5NCQ5 438 aa25.95■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc25a38Q91XD8 326 aa25.95■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Spint1Q9R097 507 aa25.95■■□□□ 1.75
Hdac3-201ENSMUST00000043498 ImpactO55091 318 aa25.95■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc2a13Q3UHK1 637 aa25.95■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ppp2r5cQ60996 524 aa25.95■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cabp7Q91ZM8 215 aa25.95■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Krt78E9Q0F0 1068 aa25.94■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zfp957Q3UT76 567 aa25.94■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zscan22Q8BGS5 496 aa25.94■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa25.94■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Snx29Q9D3S3 818 aa25.94■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 NfkbieO54910 364 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 StamP70297 548 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Trim47Q8C0E3 641 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sgpp1Q9JI99 430 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Hoxc13P50207 328 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lmntd2Q0VET5 664 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pnma5Q5DTT8 618 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nim1kQ8BHI9 436 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cdca8Q8BHX3 289 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zfp202Q8C879 641 aa25.93■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 YdjcQ14BV6 310 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Krt9Q6RHW0 743 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Btbd7Q8CFE5 1130 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nap1l5Q9JJF0 156 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Stxbp4Q9WV89 557 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Trak2Q6P9N8 913 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pcmtd1P59913 357 aa25.91■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gas2l3Q3UWW6 683 aa25.91■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Foxd1Q61345 456 aa25.91■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sun2Q8BJS4 731 aa25.91■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nemp2Q8CB65 421 aa25.91■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Washc1Q8VDD8 475 aa25.91■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Znf704Q9ERQ3 566 aa25.91■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zscan29E9Q5B4 869 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ece2Q80Z60 881 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rpap3Q9D706 660 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Timm44O35857 452 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Il4rP16382 810 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rasa2P58069 847 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Clec16aQ80U30 1036 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Trib2Q8K4K3 343 aa25.9■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cops5O35864 334 aa25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mt-CybP00158 381 aa25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Hoxd10P28359 340 aa25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atp9bP98195 1146 aa25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ly9Q01965 654 aa25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tff2Q03404 129 aa25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Prmt6Q6NZB1 378 aa25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Podnl1Q6P3Y9 559 aa25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm9992B2RWK3 458 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Olfr67F8VPJ8 320 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm3138K7N754 218 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Unc93aQ710D3 458 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 GypcQ78HU7 95 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Clic6Q8BHB9 596 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Limd1Q9QXD8 668 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Serpina16D3Z660 418 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Setd4P58467 439 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa25.88■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gml2G5E8L7 176 aa25.87■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Psmc2P46471 433 aa25.87■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 RragbQ6NTA4 374 aa25.87■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 E2f4Q8R0K9 410 aa25.87■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa25.87■■□□□ 1.73
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Hdhd5Q91WM2 419 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16 ms