RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040580.6

Syde1-201, Transcript of Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde1, Length 3,288 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Itm2cQ91VK4 269 aa20.53■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trim9Q8C7M3 817 aa20.53■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ttc27Q8CD92 847 aa20.53■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Traf7Q922B6 594 aa20.53■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ears2Q9CXJ1 523 aa20.53■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tmem192Q9CXT7 266 aa20.53■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Magea8O89012 320 aa20.52■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Sestd1Q80UK0 696 aa20.52■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fermt2Q8CIB5 680 aa20.52■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Lypla2Q9WTL7 231 aa20.52■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pnma5Q5DTT8 618 aa20.52■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Krt79Q8VED5 531 aa20.52■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 Adgrf4Q9D2L6 698 aa20.52■□□□□ 0.88
Syde1-201ENSMUST00000040580 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa20.52■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Etv6P97360 485 aa20.52■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Igdcc3Q8BQC3 813 aa20.52■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Lrrc41Q8K1C9 807 aa20.52■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rnf181Q9CY62 165 aa20.52■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tbx18Q9EPZ6 613 aa20.52■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mmel1Q9JLI3 765 aa20.52■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm11549A0A286YD83 63 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fam184aE9PW83 1143 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Zfp213E9QAW0 468 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Aggf1Q7TN31 711 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Brms1Q99N20 246 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Erich6bQ9D4S6 220 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 CluhQ5SW19 1315 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Man1a2P39098 641 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cfap52Q5F201 620 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rgl2Q61193 778 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gpd2Q64521 727 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Setdb2Q8C267 713 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm7168A0AUV4 508 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm4307E9PZY4 289 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm4312K9J7E2 289 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa20.51■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 SelpQ01102 768 aa20.5■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Syt10Q9R0N4 523 aa20.5■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Skor2A7M7C7 1008 aa20.5■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Kif5bQ61768 963 aa20.5■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dqx1Q924H9 718 aa20.5■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nudt5Q9JKX6 218 aa20.5■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rufy4Q3TYX8 563 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trpc6Q61143 930 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Q9D5Q8 446 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cabp5Q9JLK3 173 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Arhgap6O54834 987 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 UgcgO88693 394 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pbxip1Q3TVI8 727 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Foxn3Q499D0 457 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Btbd7Q8CFE5 1130 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Taf6lQ8R2K4 616 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 AacsQ9D2R0 672 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm10436L7N1Y3 520 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Adamts19P59509 1210 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 PdgfcQ8CI19 345 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 OtoaQ8K561 1137 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ccdc105Q9D4K7 499 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nap1l5Q9JJF0 156 aa20.49■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Herc3A6H6S0 1050 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tmigd3G3X8R9 209 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 TazI7HJS2 263 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Sun2Q8BJS4 731 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nemp2Q8CB65 421 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Krt36B1AQ75 473 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gcnt4E9Q649 455 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ccdc162pQ0VG85 912 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Slain1Q68FF7 579 aa20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 TxnP10639 105 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nol4P60954 483 aa20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Phtf1Q9QZ09 761 aa20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Naa35Q6PHQ8 725 aa20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Eps8l1Q8R5F8 716 aa20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 4933427I04RikQ3V053 235 aa20.47■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 H2-Q4Q8HWB2 354 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Filip1Q9CS72 1211 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 B020004C17RikJ3QP07 232 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pla2g4bP0C871 782 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mier3Q3UHF3 551 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Krt39Q6IFX4 482 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Enox2Q8R0Z2 598 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Kcnk13Q8R1P5 405 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa20.46■□□□□ 0.87
Syde1-201ENSMUST00000040580 Taf1bP97358 586 aa20.45■□□□□ 0.86
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ppp2r5cQ60996 524 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.9 ms