RNA–Protein interactions for RNA: YOR368W

RAD17, Transcript of Checkpoint protein, yeast

Gene RAD17, Length 1,206 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD17	YOR368W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
RAD17	YOR368W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YIM1	P28625	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	CBP4	P37267	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	THI2	P38141	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	MDM31	P38880	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	SHO1	P40073	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	ELP2	P42935	788 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	GYP6	P32806	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	HCS1	P34243	683 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	RPH1	P39956	796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	HAT2	P39984	401 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	GWT1	P47026	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	SOV1	Q04748	898 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	AYT1	Q12226	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	SET6	Q12529	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	CYB2	P00175	591 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	RML2	P32611	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	PMU1	P36069	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	ALG8	P40351	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	COS10	P52924	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	SIL1	Q08199	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	HSL1	P34244	1518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	ATR1	P13090	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YDL186W	P48568	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	PPT2	Q12036	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	HEM2	P05373	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	PDX1	P16451	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	SNT1	P25357	1226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	RPC53	P25441	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	REC114	P32841	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	NIP100	P33420	868 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YJL213W	P40896	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	FMS1	P50264	508 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	ISN1	Q99312	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	RIP1	P08067	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	REC107	P21651	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YCR051W	P25631	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	FRE2	P36033	711 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	RSM22	P36056	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	SSU1	P41930	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	ARK1	P53974	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	CTF3	Q12748	733 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD17	YOR368W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	PHO2	P07269	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	ADK2	P26364	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	YME2	P32843	850 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	VHC1	P38329	1120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	RTT103	Q05543	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	AGA1	P32323	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	STB6	P36085	766 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	ARA1	P38115	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	GCD10	P41814	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	ROY1	Q04847	553 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	BUD4	P47136	1447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	SEC63	P14906	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	NDI1	P32340	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	PIM1	P36775	1133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	TRS85	P46944	698 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	COS5	P47187	383 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	DSL1	P53847	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	PNG1	Q02890	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD17	YOR368W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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