RNA–Protein interactions for RNA: YLR132C

USB1, Transcript of Putative phosphodiesterase specific for U6 snRNA 3' end modification, yeast

Gene USB1, Length 873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
USB1	YLR132C	GRX6	Q12438	231 aa		4	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	CLC1	P17891	233 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	SEC62	P21825	274 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	PFF1	P38244	976 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YTA12	P40341	825 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	AZF1	P41696	914 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YJR154W	P47181	346 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	SAM50	P53969	484 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	SMA1	Q02651	245 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	VTA1	Q06263	330 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	GRS2	Q06817	618 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	ERG3	P32353	365 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	SEC66	P33754	206 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	BYE1	P36106	594 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	CBP4	P37267	147 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	MBB1	P39534	108 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YJL068C	P40363	299 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	CSM2	P40465	213 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	DIC1	Q06143	298 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	FMP45	Q07651	309 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	CSR2	Q12734	1121 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	COR1	P07256	457 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	EXO70	P19658	623 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	RAD14	P28519	371 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	ACH1	P32316	526 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	NFU1	P32860	256 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	SPC34	P36131	295 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	URB2	P47108	1174 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	BUD32	P53323	261 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	YOR365C	Q08844	703 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	BSC1	Q12140	328 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USB1	YLR132C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
USB1	YLR132C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	DBF4	P32325	704 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	HCS1	P34243	683 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	DUG2	P38149	878 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	EFM2	P38347	419 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	SHC1	P39000	512 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	YIL089W	P40500	205 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	POP1	P41812	875 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	SSU1	P41930	458 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	IVY1	Q04934	453 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	HKR1	P41809	1802 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	RHO2	P06781	192 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	BAR1	P12630	587 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	APE1	P14904	514 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	GLN3	P18494	730 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	AFG1	P32317	509 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	UTR4	P32626	227 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	REC114	P32841	428 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	ECM15	P35195	104 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	RIM2	P38127	377 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	AIM22	P47051	409 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	GPI1	P53306	609 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	ERO1	Q03103	563 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	THI20	Q08224	551 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	SPS4	P09937	338 aa		3.94	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	ELO2	P25358	347 aa		3.94	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	NRT1	Q08485	598 aa		3.94	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	AUS1	Q08409	1394 aa		3.93	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	YCR007C	P25354	239 aa		3.93	□□□□□ -1.78
USB1	YLR132C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78

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