RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.65■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.65■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.65■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.65■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 YDJCA8MPS7 323 aa20.64■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 MMP14P50281 582 aa20.64■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 TTLL6Q8N841 843 aa20.64■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.64■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 PSMD1Q99460 953 aa20.64■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 DNAJC7Q99615 494 aa20.64■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 VPS33BQ9H267 617 aa20.64■□□□□ 0.9
CLN8-211ENST00000636934 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
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CLN8-211ENST00000636934 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.64■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.64■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.64■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 DYMQ7RTS9 669 aa20.64■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 ERMNQ8TAM6 284 aa20.64■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 DDX12PQ92771 950 aa20.64■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 MEIS2O14770 477 aa20.63■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 SPDYE6P0CI01 402 aa20.63■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 IDEP14735 1019 aa20.63■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 MAP3K9P80192 1104 aa20.63■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 FIGNQ5HY92 759 aa20.63■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 FAM151AQ8WW52 585 aa20.63■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 UBXN4Q92575 508 aa20.63■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.63■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.63■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 TTC26A0AVF1 554 aa20.62■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 KIF20AO95235 890 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 ERVK-24P63145 666 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 DLGAP5Q15398 846 aa20.62■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 OGFOD1Q8N543 542 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 KIFC2Q96AC6 838 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 GOPCQ9HD26 462 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 EHHADHQ08426 723 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 SREBF1P36956 1147 aa20.61■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 FAM20AQ96MK3 541 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 ZBED6P86452 979 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 KCNK18Q7Z418 384 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 PANK4Q9NVE7 773 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 PIK3CDO00329 1044 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 FANCGO15287 622 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 PLA2G4BP0C869 781 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 COASYQ13057 564 aa20.59■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 HPS3Q969F9 1004 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 CARD6Q9BX69 1037 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 SH2D4AQ9H788 454 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.59■□□□□ 0.89
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CLN8-211ENST00000636934 NDUFA10O95299 355 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 CIITAP33076 1130 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 STAT2P52630 851 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 KRT83P78385 493 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 ECM1Q16610 540 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 MEA1Q16626 185 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 USH1GQ495M9 461 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 MIIPQ5JXC2 388 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-211ENST00000636934 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.59■□□□□ 0.89
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