RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	LILRA2	Q8N149	483 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	ATL2	Q8NHH9	583 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	USP7	Q93009	1102 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	ASIC4	Q96FT7	647 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	JMJD8	Q96S16	334 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	TTC1	Q99614	292 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	IPPK	Q9H8X2	491 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538		X6R8D5	127 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CCDC66	A2RUB6	948 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	GAS7	O60861	476 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	DGKI	O75912	1065 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CKM	P06732	381 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	RAC2	P15153	192 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CHRNA2	Q15822	529 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	TMEM177	Q53S58	311 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CEP68	Q76N32	757 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	SPRED2	Q7Z698	418 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CABP7	Q86V35	215 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	LZTR1	Q8N653	840 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	UBR7	Q8N806	425 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CHST14	Q8NCH0	376 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CEP89	Q96ST8	783 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CDIP1	Q9H305	208 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	IFT22	Q9H7X7	185 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538		M0R2C6	588 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	MAFK	O60675	156 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	RAB11FIP3	O75154	756 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	EYA4	O95677	639 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	F2	P00734	622 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	GNAT1	P11488	350 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	GDNF	P39905	211 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CD96	P40200	585 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	SNX17	Q15036	470 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	NLRP10	Q86W26	655 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	DPF3	Q92784	378 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	MTA3	Q9BTC8	594 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	GULP1	Q9UBP9	304 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538		A0A1W2PQJ5	194 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	C22orf46	C9J442	243 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	KRIT1	O00522	736 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	WNT11	O96014	354 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	HPX	P02790	462 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	PDGFRB	P09619	1106 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	PYGM	P11217	842 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	BPI	P17213	487 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	SSTR4	P31391	388 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	DNM2	P50570	870 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	HK2	P52789	917 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	STRN3	Q13033	797 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	GPR19	Q15760	415 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	FERMT3	Q86UX7	667 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	USP33	Q8TEY7	942 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	BTG4	Q9NY30	223 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	FUCA1	P04066	466 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	ARL4A	P40617	200 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	SLC6A11	P48066	632 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EP300-208	ENST00000635538	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41

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