RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	HIPK3	Q9H422	1215 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	B4GALT4	O60513	344 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCND2	P30279	289 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP2C18	P33260	490 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	33.49	■■■□□ 2.95	6e-10	■■□□□ 11.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	PGM5	Q15124	567 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	RASEF	Q8IZ41	740 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	FANCB	Q8NB91	859 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	CUL5	Q93034	780 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	CSF2RA	P15509	400 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGAP1	Q07960	439 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	IL31RA	Q8NI17	732 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	FGD1	P98174	961 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	MMP3	P08254	477 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	SORBS3	O60504	671 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	LAMC2	Q13753	1193 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCL23	P55773	120 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	APOA5	Q6Q788	366 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBTB43	O43298	467 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGS20	O76081	388 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACR	P10323	421 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP2C9	P11712	490 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	DGKD	Q16760	1214 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94	1e-12	■■□□□ 12.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	NOD1	Q9Y239	953 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	REC8	O95072	547 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	RTN1	Q16799	776 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM161B	Q96MY7	647 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	GGPS1	O95749	300 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPTC7	Q8NI37	304 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA33	Q96N06	139 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	IL23A	Q9NPF7	189 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	TGFB3	P10600	412 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	CPA1	P15085	419 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM240	Q5SV17	173 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF365	Q70YC5	407 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSPA4	P34932	840 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	33.37	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIK3CD	O00329	1044 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	MEIS2	O14770	477 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	STAM2	O75886	525 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	ALG1	Q9BT22	464 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF286B	P0CG31	522 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	SP2	Q02086	613 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	C7orf31	Q8N865	590 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	KAT2B	Q92831	832 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCLY	Q96I15	445 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		33.35	■■■□□ 2.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms