RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CNNM2Q9H8M5 875 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 CASTP20810 708 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF16Q5VV41 709 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 CHST3Q7LGC8 479 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 TET1Q8NFU7 2136 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 TANC1Q9C0D5 1861 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 CAGE1Q8TC20 777 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 PXMP2Q9NR77 195 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 OPLAHO14841 1288 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 NR3C2P08235 984 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 DGKDQ16760 1214 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 HERC6Q8IVU3 1022 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC155Q8N6L0 562 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 AMNQ9BXJ7 453 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 MYH6P13533 1939 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 BAIAP3O94812 1187 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 CFBP00751 764 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 HSD17B4P51659 736 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 GHRHRQ02643 423 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 SEC23AQ15436 765 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 MTMR8Q96EF0 704 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 IL25Q9H293 177 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 BDP1A6H8Y1 2624 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 KLRF2D3W0D1 207 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 GPNMBQ14956 572 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 MICALL1Q8N3F8 863 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 MRVI1Q9Y6F6 885 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 RFXAPO00287 272 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 SELPP16109 830 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 RBL2Q08999 1139 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 LAMC2Q13753 1193 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 CERS4Q9HA82 394 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 KIF28PB7ZC32 967 aa29■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 TAP1Q03518 808 aa29■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 CYB5R4Q7L1T6 521 aa29■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 PPTC7Q8NI37 304 aa29■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 MTCH2Q9Y6C9 303 aa29■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
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PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB5O15062 677 aa28.99■■■□□ 2.23
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PTPRF-216ENST00000617451 PSEN2P49810 448 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 C7orf31Q8N865 590 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 PDCD2LQ9BRP1 358 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 HAS3O00219 553 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 RGS20O76081 388 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 F2P00734 622 aa28.98■■■□□ 2.23
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PTPRF-216ENST00000617451 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 CXCL10P02778 98 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 CKBP12277 381 aa28.97■■■□□ 2.23
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PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ6P48051 423 aa28.97■■■□□ 2.23
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PTPRF-216ENST00000617451 IL27Q8NEV9 243 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 ALG1Q9BT22 464 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF286BP0CG31 522 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 VSIG10LQ86VR7 867 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 ARNTL2Q8WYA1 636 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PTPRF-216ENST00000617451 TLL1O43897 1013 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 NBNO60934 754 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 PPFIA4O75335 1185 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 KCNV1Q6PIU1 500 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 BMP1P13497 986 aa28.94■■■□□ 2.22
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