RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593068.6

TMEM259-211, Transcript of transmembrane protein 259, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM259, Length 1,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259-211ENST00000593068 FLOT1O75955 427 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM259-211ENST00000593068 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM259-211ENST00000593068 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM259-211ENST00000593068 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM259-211ENST00000593068 MED15Q96RN5 788 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM259-211ENST00000593068 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF536O15090 1300 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM259-211ENST00000593068 SLC37A4O43826 429 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 USP14P54578 494 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 POTEDQ86YR6 584 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CCP110O43303 1012 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 LDHDQ86WU2 507 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ANO3Q9BYT9 981 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 RLFQ13129 1914 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CDC25AP30304 524 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ELP3Q9H9T3 547 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 PTPRFP10586 1907 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 TRAF5O00463 557 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 TMEM139Q8IV31 216 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CPXCR1Q8N123 301 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 MTRQ99707 1265 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 A0A1B0GTH6 734 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 PP2D1A8MPX8 630 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CFBP00751 764 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 KCNB1Q14721 858 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ATG4CQ96DT6 458 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 C12orf42Q96LP6 360 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CSADQ9Y600 493 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CASP1P29466 404 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 UIMC1Q96RL1 719 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ICAM1P05362 532 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 NR1I3Q14994 352 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 GJA10Q969M2 543 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 C19orf81C9J6K1 198 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 NF2P35240 595 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 SPAG1Q07617 926 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 PAK1Q13153 545 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CABP7Q86V35 215 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 STAMQ92783 540 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 OTUD5Q96G74 571 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 RRAGCQ9HB90 399 aa20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 SOCS7O14512 581 aa20.09■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 AP3B2Q13367 1082 aa20.09■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ERO1AQ96HE7 468 aa20.09■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.09■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.09■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 NFIBO00712 420 aa20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ARHGAP6O43182 974 aa20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 TREML2Q5T2D2 321 aa20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 MTMR9Q96QG7 549 aa20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 RAB34Q9BZG1 259 aa20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TMEM259-211ENST00000593068 ABCB11O95342 1321 aa20.08■□□□□ 0.8
TMEM259-211ENST00000593068 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.08■□□□□ 0.8
TMEM259-211ENST00000593068 PIK3CDO00329 1044 aa20.08■□□□□ 0.8
TMEM259-211ENST00000593068 VWA5AO00534 786 aa20.08■□□□□ 0.8
TMEM259-211ENST00000593068 IRF6O14896 467 aa20.08■□□□□ 0.8
TMEM259-211ENST00000593068 ALAS1P13196 640 aa20.08■□□□□ 0.8
TMEM259-211ENST00000593068 ARHGAP4P98171 946 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms