RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-208ENST00000589104 TRIM58Q8NG06 486 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 PSMA7O14818 248 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 HAS1Q92839 578 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SEPT2Q15019 361 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 ENC1O14682 589 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 KRT86O43790 486 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 FNTAP49354 379 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 CABP7Q86V35 215 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 DEF6Q9H4E7 631 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 RNF14Q9UBS8 474 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 INF2Q27J81 1249 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SLC51AQ86UW1 340 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 57.9
KDM4B-208ENST00000589104 RAD54LQ92698 747 aa14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 MAN2A1Q16706 1144 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 EMBQ6PCB8 327 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 BORCS6Q96GS4 357 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 HSPA2P54652 639 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 TFAP4Q01664 338 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 ALS2CLQ60I27 953 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 NDST4Q9H3R1 872 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 KIF11P52732 1056 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 JAM2P57087 298 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 KCNK18Q7Z418 384 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 PACS2Q86VP3 889 aa14.9□□□□□ -0.02
KDM4B-208ENST00000589104 SLC37A4O43826 429 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 TCEAL1Q15170 157 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 NAB2Q15742 525 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 NFIL3Q16649 462 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 GBP6Q6ZN66 633 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 USP17L3A6NCW0 530 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 USP17L4A6NCW7 530 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 GUCY2CP25092 1073 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 HOXD13P35453 343 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 IRAK1P51617 712 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 NEK8Q86SG6 692 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.89□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 ARID2Q68CP9 1835 aa14.88□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 WDR81Q562E7 1941 aa14.88□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 MCM6Q14566 821 aa14.88□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 MAP9Q49MG5 647 aa14.88□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.88□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 POTEDQ86YR6 584 aa14.88□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 SCFD2Q8WU76 684 aa14.88□□□□□ -0.03
KDM4B-208ENST00000589104 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 13.6
KDM4B-208ENST00000589104 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms