RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584796.5

VAPA-208, Transcript of VAMP associated protein A, human

TSL 3

Gene VAPA, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAPA-208	ENST00000584796	KY	Q8NBH2	561 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	C22orf46	C9J442	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	INSRR	P14616	1297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ITGA1	P56199	1179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ADAM17	P78536	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796		X6R8D5	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	NACAD	O15069	1562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ARNTL	O00327	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	PLAT	P00750	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	FPR2	P25090	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TESK1	Q15569	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	GPR20	Q99678	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	SCG5	P05408	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	GTF2A2	P52657	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	8e-10	■□□□□ 9.7
VAPA-208	ENST00000584796	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TBX1	O43435	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	HOXC12	P31275	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	CEP68	Q76N32	757 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	LGI4	Q8N135	537 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	DIO2	Q92813	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ITGAV	P06756	1048 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	BCL6	P41182	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	STAT5A	P42229	794 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ADAM9	Q13443	819 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	MYO1B	O43795	1136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF28	P17035	718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	NKX3-2	P78367	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	CPZ	Q66K79	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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