RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 SERTM1A2A2V5 107 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 EPOPA6NHQ4 379 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 LPXNO60711 386 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ADAMTS4O75173 837 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 IL2RAP01589 272 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 CA3P07451 260 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF853P0CG23 659 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 SLURP2P0DP57 97 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 MYOGP15173 224 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 IL9P15248 144 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 FSHRP23945 695 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ACLYP53396 1101 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 WNT7BP56706 349 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 GRB10Q13322 594 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 RTN1Q16799 776 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 DPP9Q86TI2 863 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 LINS1Q8NG48 757 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 MYH8P13535 1937 aa6.37□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 OPLAHO14841 1288 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 PDE8BO95263 885 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 CD4P01730 458 aa6.36□□□□□ -1.39
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TRIM25-208ENST00000574234 ASNSP08243 561 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 FGRP09769 529 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ADORA2AP29274 412 aa6.36□□□□□ -1.39
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TRIM25-208ENST00000574234 NOS2P35228 1153 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ZP2Q05996 745 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ARID5BQ14865 1188 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 WDR78Q5VTH9 848 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 C12orf42Q96LP6 360 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
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TRIM25-208ENST00000574234 GINM1Q9NU53 330 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 KLK14Q9P0G3 267 aa6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 FAM50BQ9Y247 325 aa6.36□□□□□ -1.39
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TRIM25-208ENST00000574234 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 TAP1Q03518 808 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 TLR1Q15399 786 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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TRIM25-208ENST00000574234 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 NEK9Q8TD19 979 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.35□□□□□ -1.39
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TRIM25-208ENST00000574234 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.35□□□□□ -1.39
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TRIM25-208ENST00000574234 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ARVCFO00192 962 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 GIPC1O14908 333 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 AKR1A1P14550 325 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 FGFR2P21802 821 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 CYP2C18P33260 490 aa6.34□□□□□ -1.39
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