RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CCDC40-211ENST00000574099 ALG1Q9BT22 464 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC40-211ENST00000574099 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC40-211ENST00000574099 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC40-211ENST00000574099 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 HAND2P61296 217 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 GJD3Q8N144 294 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 C7orf31Q8N865 590 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 TBC1D5Q92609 795 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF286BP0CG31 522 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 RBL2Q08999 1139 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 WNT8BQ93098 351 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 UIMC1Q96RL1 719 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 COL20A1Q9P218 1284 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 FGAP02671 866 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 PSEN2P49810 448 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 IKBKEQ14164 716 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 MYH6P13533 1939 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 PRR33A8MZF0 331 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 SNHG28P0DPA3 235 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 MBTPS1Q14703 1052 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 MFSD10Q14728 455 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 ALX1Q15699 326 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 DGKDQ16760 1214 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 FAM227BQ96M60 508 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 A0A0D9SFI3 127 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 SORBS3O60504 671 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 EFCAB14O75071 495 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 PTK7Q13308 1070 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 STXBP2Q15833 593 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 RGS22Q8NE09 1264 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 RMDN3Q96TC7 470 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC40-211ENST00000574099 ABCB11O95342 1321 aa20.52■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 LGR5O75473 907 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 F2P00734 622 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 EVI5LQ96CN4 794 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 TTC14Q96N46 770 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 INSL6Q9Y581 213 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 AMHP03971 560 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 HIC1Q14526 733 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 IWS1Q96ST2 819 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 NEDD4P46934 1319 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 HAS3O00219 553 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 PPTC7Q8NI37 304 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 ALADP13716 330 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 THPOP40225 353 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 LAMC2Q13753 1193 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 PTPROQ16827 1216 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC40-211ENST00000574099 EPC2Q52LR7 807 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms