RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.53■□□□□ 0.88
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CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB43O43298 467 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 B4GALT4O60513 344 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 REC8O95072 547 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 TIMP1P01033 207 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 FPGSQ05932 587 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP1Q07960 439 aa20.52■□□□□ 0.88
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CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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CTDNEP1-207ENST00000572043 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGS20O76081 388 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CD4P01730 458 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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CTDNEP1-207ENST00000572043 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.51■□□□□ 0.87
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CTDNEP1-207ENST00000572043 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNB2Q92953 911 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CUL5Q93034 780 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 MMP3P08254 477 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 Q6ZUG5 572 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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CTDNEP1-207ENST00000572043 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CEP290O15078 2479 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 LTBP2Q14767 1821 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYP2C18P33260 490 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 APOBRQ0VD83 1088 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 MFSD5Q6N075 450 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 HIPK3Q9H422 1215 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 MEIS2O14770 477 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 KPNA6O60684 536 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSF2RAP15509 400 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBE2SQ16763 222 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 Q7L0L9 218 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 BRF1Q92994 677 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 GGPS1O95749 300 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACRP10323 421 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYP2C9P11712 490 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPS6KB1P23443 525 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDC27P30260 824 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCL23P55773 120 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 SP2Q02086 613 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 LAMC2Q13753 1193 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM199Q8N511 208 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIK3CDO00329 1044 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF286BP0CG31 522 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.874e-6■□□□□ 8.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 DGKDQ16760 1214 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA33Q96N06 139 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSMA5P28066 241 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 FUT2Q10981 343 aa20.45■□□□□ 0.86
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CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPTC7Q8NI37 304 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 NAPAP54920 295 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNPTABQ3T906 1256 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 DEFB123Q8N688 67 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 KAT2BQ92831 832 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.862e-6■■■□□ 15.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 ALG1Q9BT22 464 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYH6P13533 1939 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPFIA3O75145 1194 aa20.43■□□□□ 0.86
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