RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	NBN	O60934	754 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	GH1	P01241	217 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	ERVK-21	P61565	698 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	DEFB103A	P81534	67 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	GJB5	O95377	273 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	CKB	P12277	381 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	USH1G	Q495M9	461 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	RAD9A	Q99638	391 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169		A0A0D9SFI3	127 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	EFCAB14	O75071	495 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	DGKD	Q16760	1214 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF4-238	ENST00000568169	HAS3	O00219	553 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	PSEN2	P49810	448 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	HAND2	P61296	217 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	IKBKE	Q14164	716 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	STXBP2	Q15833	593 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ABCB11	O95342	1321 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	F2	P00734	622 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	PDE1A	P54750	535 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	PTK7	Q13308	1070 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	WNT8B	Q93098	351 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	MFSD10	Q14728	455 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ESR2	Q92731	530 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TCF4-238	ENST00000568169	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28

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