RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CAGE1	Q8TC20	777 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	POTEM	A6NI47	508 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	GYS1	P13807	737 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1B1	P15121	316 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	EHHADH	Q08426	723 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC96	Q2M329	555 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	FAM71B	Q8TC56	605 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	DDX12P	Q92771	950 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	DEF6	Q9H4E7	631 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	TFR2	Q9UP52	801 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A4	O43511	780 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CYP27A1	Q02318	531 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	FAM182B	Q5T319	152 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	COA1	Q9GZY4	146 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	JADE2	Q9NQC1	790 aa		20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	20.44	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	PRLR	P16471	622 aa		20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2I	P78347	998 aa		20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	PICALM	Q13492	652 aa		20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		20.43	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	EDIL3	O43854	480 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	MARCH6	O60337	910 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SRGAP2	O75044	1071 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	KIF11	P52732	1056 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	VPS18	Q9P253	973 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1B10	O60218	316 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ITIH3	Q06033	890 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	NEK11	Q8NG66	645 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D4A	Q9H788	454 aa		20.42	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF263	O14978	683 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB5	O15062	677 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SP8	Q8IXZ3	490 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	RUBCN	Q92622	972 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SNX12	Q9UMY4	172 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	GNA14	O95837	355 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	HYI	Q5T013	277 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC102A	Q96A19	550 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		20.41	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	20.4	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	20.4	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	RRAGA	Q7L523	313 aa		20.4	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		20.4	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CEP63	Q96MT8	703 aa		20.4	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		20.4	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		20.4	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DOA	P06340	250 aa		20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	LMAN1	P49257	510 aa		20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	HAS1	Q92839	578 aa		20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR8	Q96EF0	704 aa		20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		20.39	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC53	A6NM62	1247 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PJA2	O43164	708 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	COASY	Q13057	564 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2S	Q16763	222 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK18	Q7Z418	384 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	BAP1	Q92560	729 aa		20.39	■□□□□ 0.85

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