RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNB2	Q92953	911 aa		25.18	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	25.18	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		25.17	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		25.17	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	25.17	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		25.17	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	AFG1L	Q8WV93	481 aa		25.17	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		25.17	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		25.17	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200		Q7L0L9	218 aa		25.16	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		25.16	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB123	Q8N688	67 aa		25.16	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP3	P08254	477 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CSF2RA	P15509	400 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2C18	P33260	490 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT32	Q14532	448 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	APOA5	Q6Q788	366 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	HIPK3	Q9H422	1215 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		25.15	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3CD	O00329	1044 aa		25.14	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	25.14	■■□□□ 1.62	1e-6	■□□□□ 10.8
PPP4C-205	ENST00000563200	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		25.14	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MICU3	Q86XE3	530 aa		25.14	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM199	Q8N511	208 aa		25.14	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	25.14	■■□□□ 1.62	2e-6	■■■■□ 20.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	25.14	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		25.14	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		25.14	■■□□□ 1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MEIS2	O14770	477 aa		25.13	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CCND2	P30279	289 aa		25.13	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	25.13	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	NEFL	P07196	543 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA4	P34932	840 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SP2	Q02086	613 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMC2	Q13753	1193 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	KAT2B	Q92831	832 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFB3	P10600	412 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM240	Q5SV17	173 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RASIP1	Q5U651	963 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PPTC7	Q8NI37	304 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	25.12	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	EYS	Q5T1H1	3165 aa		25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT2	Q10981	343 aa		25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		25.11	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	DGKD	Q16760	1214 aa		25.1	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	25.1	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		25.1	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	25.1	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		25.1	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	VWCE	Q96DN2	955 aa		25.1	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	25.1	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	IL23A	Q9NPF7	189 aa		25.1	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0C4DFX4	3053 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB43	O43298	467 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	STAM2	O75886	525 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ACR	P10323	421 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2C9	P11712	490 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ICAM3	P32942	547 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SESTD1	Q86VW0	696 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	25.09	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		25.08	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RCAN1	P53805	252 aa		25.08	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL23	P55773	120 aa		25.08	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		25.08	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	25.08	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF365	Q70YC5	407 aa		25.08	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CUL5	Q93034	780 aa		25.08	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		25.08	■■□□□ 1.61
PPP4C-205	ENST00000563200	REC8	O95072	547 aa		25.07	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GGPS1	O95749	300 aa		25.07	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	F2	P00734	622 aa		25.07	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CPA1	P15085	419 aa		25.07	■■□□□ 1.6

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