RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561335.2

AC090888.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC090888.1, Length 1,141 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC090888.1-201ENST00000561335 NFKB2Q00653 900 aa6.71□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 MBLAC2Q68D91 279 aa6.71□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.71□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.71□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 MMP19Q99542 508 aa6.71□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 MTA3Q9BTC8 594 aa6.71□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 FUCA1P04066 466 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 HOXC12P31275 282 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 ECI1P42126 302 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 CYP4F3Q08477 520 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 ZNF827Q17R98 1081 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 FERMT3Q86UX7 667 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 FRS2Q8WU20 508 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 EPN3Q9H201 632 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.7□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 AGRPO00253 132 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 KLF4O43474 513 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 CYP2C8P10632 490 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 DDR2Q16832 855 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 INF2Q27J81 1249 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 IQCEQ6IPM2 695 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 GGNQ86UU5 652 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 GPR20Q99678 358 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 BTG4Q9NY30 223 aa6.69□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 NTRK1P04629 796 aa6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 CNR2P34972 360 aa6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 KCNJ6P48051 423 aa6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 DPF3Q92784 378 aa6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 CCDC140Q96MF4 163 aa6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.68□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 NOBOXO60393 691 aa6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 CPP00450 1065 aa6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 SCG5P05408 212 aa6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 DIO2Q92813 273 aa6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 DDX11Q96FC9 970 aa6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 NOX5Q96PH1 765 aa6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 LNPKQ9C0E8 428 aa6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 GFRA1P56159 465 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 KRTAP10-2P60368 255 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 CCDC103Q8IW40 242 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 C22orf46C9J442 243 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 ARNTLO00327 626 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 MYO1BO43795 1136 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 INSRRP14616 1297 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 GRIA2P42262 883 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 PPP2R2AP63151 447 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 KCNAB2Q13303 367 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 RAB33AQ14088 237 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 FAM124AQ86V42 546 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.65□□□□□ -1.34
AC090888.1-201ENST00000561335 A0A1W2PQU0 124 aa6.64□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 FPR2P25090 351 aa6.64□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 LTBRP36941 435 aa6.64□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.64□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 SEC14L1Q92503 715 aa6.64□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.64□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 CAPNS1P04632 268 aa6.63□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 BCL6P41182 706 aa6.63□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 GTF2A2P52657 109 aa6.63□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 TESK1Q15569 626 aa6.63□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.63□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.63□□□□□ -1.35
AC090888.1-201ENST00000561335 CEP68Q76N32 757 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms