RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 FAM26DQ5JW98 314 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP48Q86UV5 1035 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1B0GUL6 1792 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 HMMRO75330 724 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 MYL6BP14649 208 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 MAP2K2P36507 400 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 LILRA6Q6PI73 481 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 GATA6Q92908 595 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 IL17RAQ96F46 866 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RNF186Q9NXI6 227 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 GGA3Q9NZ52 723 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 NCANO14594 1321 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 FAM196BA6NMK8 535 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 DLGAP3O95886 979 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ACPPP15309 386 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TDO2P48775 406 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CAP1Q01518 475 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SPRED2Q7Z698 418 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PSMD14O00487 310 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PRRG2O14669 202 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 FLT3P36888 993 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 NOGQ13253 232 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 UBE4AQ14139 1066 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC184Q52MB2 194 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 RGMBQ6NW40 437 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 RUNDC1Q96C34 613 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PIF1Q9H611 641 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 FZD1Q9UP38 647 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CA12O43570 354 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TBC1D8O95759 1140 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 COL6A1P12109 1028 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SATB1Q01826 763 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PAF1Q8N7H5 531 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 GPR152Q8TDT2 470 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms