RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	FANCL	Q9NW38	375 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	AGL	P35573	1532 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	PAM	P19021	973 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	MAP4K2	Q12851	820 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP4	Q13115	394 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	NTRK3	Q16288	839 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SDE2	Q6IQ49	451 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	USP53	Q70EK8	1073 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf159	Q96HA4	380 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	RERE	Q9P2R6	1566 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2R1	Q13018	1463 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ZMYM3	Q14202	1370 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D8	O95759	1140 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	KIR3DS1	Q14943	382 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SLC14A2	Q15849	920 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	INF2	Q27J81	1249 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	MBLAC2	Q68D91	279 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC103	Q8IW40	242 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	JMJD8	Q96S16	334 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM260	Q9NX78	707 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	UNC13B	O14795	1591 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	ASMTL	O95671	621 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	LCP1	P13796	627 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	GDNF	P39905	211 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	GALK1	P51570	392 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	RTP1	P59025	263 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	NBPF11	Q86T75	865 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	JAML	Q86YT9	394 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934		Q8N3U1	123 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	OXR1	Q8N573	874 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	APPBP2	Q92624	585 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	DIO2	Q92813	273 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC120	Q96HB5	630 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	SP110	Q9HB58	689 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	DEPDC5	O75140	1603 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	ABCC3	O15438	1527 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	NPAT	Q14207	1427 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	NOTO	A8MTQ0	251 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	PSPN	O60542	156 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	IDI1	Q13907	227 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	RGL3	Q3MIN7	710 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	HOMER1	Q86YM7	354 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	MMP19	Q99542	508 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	PTPRT	O14522	1441 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PQY0	241 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	C7orf72	A4D263	438 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	FITM1	A5D6W6	292 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	MSC	O60682	206 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	CDC45	O75419	566 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	EFEMP2	O95967	443 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINS1-210	ENST00000560934	HPX	P02790	462 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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