RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NOD1Q9Y239 953 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NEDD4P46934 1319 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LCHNA4D1U4 455 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NBNO60934 754 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EFCAB14O75071 495 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GJB5O95377 273 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 F2P00734 622 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KCNJ6P48051 423 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL4A6Q14031 1691 aa15.75■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CKBP12277 381 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HAND2P61296 217 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ERVK-21P61565 698 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DEFB103AP81534 67 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 STXBP2Q15833 593 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LY6KQ17RY6 165 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TCTN1Q2MV58 587 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USH1GQ495M9 461 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TBC1D5Q92609 795 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ESR2Q92731 530 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM122AQ96E09 287 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.74■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PTK7Q13308 1070 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DGKDQ16760 1214 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PNMA1Q8ND90 353 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPTC7Q8NI37 304 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RAD9AQ99638 391 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CPVLQ9H3G5 476 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.73■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MYH6P13533 1939 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 OPLAHO14841 1288 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GPR37L1O60883 481 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HOXC8P31273 242 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PSEN2P49810 448 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HSD17B4P51659 736 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MBTPS1Q14703 1052 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RMDN3Q96TC7 470 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SUGCTQ9HAC7 445 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.72■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PIEZO1Q92508 2521 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LINC01553A4QN01 128 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RGS20O76081 388 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LAMC2Q13753 1193 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WNT8BQ93098 351 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MTMR8Q96EF0 704 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PXMP2Q9NR77 195 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NR3C2P08235 984 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MFSD10Q14728 455 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IQCA1Q86XH1 822 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C7orf31Q8N865 590 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EMSYQ7Z589 1322 aa15.69■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KDM4AO75164 1064 aa15.69■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPFIA4O75335 1185 aa15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms