RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 LTBP2Q14767 1821 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PPC1 479 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 KIAA0355O15063 1070 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 ZEB2O60315 1214 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 CABYRO75952 493 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 SLC34A2O95436 690 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 ARHGAP1Q07960 439 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 FBXL16Q8N461 479 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.453e-10■■■■□ 21.5
CS-222ENST00000550996 A6NJR5 290 aa24.08■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 RCAN1P53805 252 aa24.08■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.08■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 BADQ92934 168 aa24.08■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 TBX21Q9UL17 535 aa24.08■■□□□ 1.45
CS-222ENST00000550996 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 PIK3CDO00329 1044 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 MYL3P08590 195 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 CPT1AP50416 773 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 FGD1P98174 961 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 ITGA7Q13683 1181 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 AFG1LQ8WV93 481 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 PSMA5P28066 241 aa24.06■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 CCND2P30279 289 aa24.06■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 NID2Q14112 1375 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 GH1P01241 217 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 CD4P01730 458 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.446e-6■■■□□ 15.4
CS-222ENST00000550996 UBE2SQ16763 222 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 TDHQ8IZJ6 230 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 SP2Q02086 613 aa24.04■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 RUFY3Q7L099 469 aa24.04■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.04■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 MMP3P08254 477 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 EPHB4P54760 987 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 SEMA3FQ13275 785 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 CUL5Q93034 780 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 STXBP3O00186 592 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 SORBS3O60504 671 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 B4GALT4O60513 344 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 EVCP57679 992 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 LRCH3Q96II8 777 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-222ENST00000550996 RAG1P15918 1043 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 KAT2BQ92831 832 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 TIMP1P01033 207 aa24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 NTRK3Q16288 839 aa24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PCNX4Q63HM2 1172 aa24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 KPNA6O60684 536 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PPFIA3O75145 1194 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 GGPS1O95749 300 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 ICAM3P32942 547 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 NAPAP54920 295 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 LAMC2Q13753 1193 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 SHHQ15465 462 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PKN1Q16512 942 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-222ENST00000550996 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.99■■□□□ 1.43
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