RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 A6NJR5 290 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 PIK3CDO00329 1044 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 MEIS2O14770 477 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 CDC27P30260 824 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 ARHGAP1Q07960 439 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 LY6KQ17RY6 165 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 BRF1Q92994 677 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CS-219ENST00000550655 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 PSMA5P28066 241 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 CCND2P30279 289 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 PSMC6P62333 389 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 FGD1P98174 961 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.867e-8■■■□□ 18
CS-219ENST00000550655 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 TBX21Q9UL17 535 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 LAMA3Q16787 3333 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 GH1P01241 217 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 ITGA7Q13683 1181 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 TDHQ8IZJ6 230 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 BADQ92934 168 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 CD4P01730 458 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 MYL3P08590 195 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.866e-6■■■□□ 15.4
CS-219ENST00000550655 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 RUFY3Q7L099 469 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 CUL5Q93034 780 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 MMP3P08254 477 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 AFG1LQ8WV93 481 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 RAG1P15918 1043 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 EVCP57679 992 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 UBE2SQ16763 222 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 SZT2Q5T011 3432 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 STXBP3O00186 592 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 KPNA6O60684 536 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 STAM2O75886 525 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 SP2Q02086 613 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CS-219ENST00000550655 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 B4GALT4O60513 344 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 TIMP1P01033 207 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 ICAM3P32942 547 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 SEMA3FQ13275 785 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 GGPS1O95749 300 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 TGFB3P10600 412 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 EPHB4P54760 987 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 NAPAP54920 295 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 LAMC2Q13753 1193 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 NTRK3Q16288 839 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 PPTC7Q8NI37 304 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-219ENST00000550655 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.1 ms