RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	HIC1	Q14526	733 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	RAD50	Q92878	1312 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	GRM6	O15303	877 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	EYA4	O95677	639 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	MMP3	P08254	477 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	MCC	P23508	829 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	ID4	P47928	161 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	ADAM15	Q13444	863 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	KRT37	O76014	449 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	ICAM1	P05362	532 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	NBL1	P41271	181 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	SLC1A4	P43007	532 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	PTK7	Q13308	1070 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CAMK1	Q14012	370 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	HAS3	O00219	553 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-208	ENST00000547298	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	UPP2	O95045	317 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	CALML3	P27482	149 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	BMPR1A	P36894	532 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	PSEN2	P49810	448 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	NUBP1	P53384	320 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	PDE4D	Q08499	809 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	HAUS7	Q99871	368 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	RB1	P06400	928 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	ATP5J	P18859	108 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	CTNNB1	P35222	781 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	PDE4B	Q07343	736 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	COASY	Q13057	564 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	GLP2R	O95838	553 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	F2	P00734	622 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	RLBP1	P12271	317 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-208	ENST00000547298	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27

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