RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 STXBP3O00186 592 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 DLX3O60479 287 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 TBC1D8O95759 1140 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 SCRN1Q12765 414 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 MAP4K2Q12851 820 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 FAM209AQ5JX71 171 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 NSMFQ6X4W1 530 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 FANCLQ9NW38 375 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.25□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 CPP00450 1065 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 CYBBP04839 570 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 DBHP09172 617 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 PFKLP17858 780 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 HSD3B2P26439 372 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 L1CAMP32004 1257 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 LIMS1P48059 325 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 NFIXQ14938 502 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 HOMER1Q86YM7 354 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 APPBP2Q92624 585 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 C1orf159Q96HA4 380 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 CDC6Q99741 560 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 F8W031 263 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 CDC45O75419 566 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 KCNJ6P48051 423 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 SYT8Q8NBV8 401 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 THBDP07204 575 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 ECI1P42126 302 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 SEPHS1P49903 392 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 FRS2Q8WU20 508 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-204ENST00000542443 SRGAP3O43295 1099 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PRR5P85299 388 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 TESK1Q15569 626 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 SP8Q8IXZ3 490 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ASMTLO95671 621 aa7.2□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PLS3P13797 630 aa7.2□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 SYN1P17600 705 aa7.2□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CORO7P57737 925 aa7.2□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 NTRK3Q16288 839 aa7.2□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ARNTLO00327 626 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 TCEA2Q15560 299 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 TKFCQ3LXA3 575 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FEZ1Q99689 392 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CLEC1BQ9P126 229 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 BLACEA4D250 179 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PAMP19021 973 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FOXO4P98177 505 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CABP7Q86V35 215 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CCDC103Q8IW40 242 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 MMP19Q99542 508 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms