RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TCHH	Q07283	1943 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	REV3L	O60673	3130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ASB14	A6NK59	587 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	WNT7A	O00755	349 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SP2	Q02086	613 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	GHRHR	Q02643	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	KRT40	Q6A162	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	FERMT2	Q96AC1	680 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	C6orf50	Q9HD87	102 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	BTBD18	B2RXH4	712 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	EDIL3	O43854	480 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	GJB1	P08034	283 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	AKR1A1	P14550	325 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ITGB5	P18084	799 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	STXBP2	Q15833	593 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	INF2	Q27J81	1249 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	KIF28P	B7ZC32	967 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477		M0R2N6	131 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SGPL1	O95470	568 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	GJA8	P48165	433 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TNFAIP2	Q03169	654 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TLK2	Q86UE8	772 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	EVPL	Q92817	2033 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ESYT2	A0FGR8	921 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ATP9A	O75110	1047 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	RARB	P10826	455 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	CCND2	P30279	289 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	NBR1	Q14596	966 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	C8orf76	Q96K31	380 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TDP2	O95551	362 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MMP1	P03956	469 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ATP2B1	P20020	1258 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	GNA11	P29992	359 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TRAF1	Q13077	416 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	CTAGE5	O15320	804 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ADAMTS4	O75173	837 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	AR	P10275	920 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	LRRC41	Q15345	812 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	IWS1	Q96ST2	819 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	VTA1	Q9NP79	307 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SREBF1	P36956	1147 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MCM2	P49736	904 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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