RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KIF5B	P33176	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LMAN1	P49257	510 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NAB2	Q15742	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CABP7	Q86V35	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RAD54L	Q92698	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EHD4	Q9H223	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PSMA7	O14818	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SLC26A4	O43511	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GLI1	P08151	1106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CYP3A7	P24462	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PROM2	Q8N271	834 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF536	O15090	1300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PDHB	P11177	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KRT86	O43790	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MOCS3	O95396	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MCM3	P25205	808 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PSMD2	Q13200	908 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	STIM1	Q13586	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LENG9	Q96B70	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LCT	P09848	1927 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZMYND10	O75800	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SLC1A4	P43007	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GNAQ	P50148	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CEP72	Q9P209	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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